Один клинический тест дает больше ответов о COVID

Исследователи из Каролинского института представляют результаты усовершенствованного клинического теста на COVID-19, который использовался для отслеживания распространения варианта омикрон в реальном времени среди шведского населения. Исследование, опубликованное в журнале Med , дает новое представление о переходе доминирования сублиний омикронов, который постоянно происходил во всем мире.

Во время первой волны пандемии COVID-19 весной 2020 года исследовательская группа Бьёрна Рейниуса из Каролинского института разработала быстрый, недорогой и точный клинический анализ COVID-19, который помог провести крупномасштабные клинические испытания даже в начале этапы пандемии.

Впоследствии этот метод был использован в миллионах клинических тестов на COVID-19 в Швеции и по всему миру. В настоящее время исследовательская группа публикует результаты усовершенствованного метода анализа.

«В ответ на быстрое распространение нового варианта COVID , омикрон BA.1, в начале декабря прошлого года мы быстро работали над дальнейшим усовершенствованием метода, чтобы мы могли также классифицировать, какой вариант вируса COVID-19 является инфицированным. человек носил», — говорит Антонио Лентини, научный сотрудник отдела медицинской биохимии и биофизики Каролинского института и первый автор исследования.

Новый метод, пользовательский вариант типирования ОТ-ПЦР, позволил определить, был ли образец пациента положительным на COVID-19 и была ли инфекция вариантом омикрон BA.1.

«Раньше нам приходилось проводить секвенирование или несколько отдельных ПЦР в дополнение к первичному клиническому тесту, чтобы получить эти результаты. Однако во время омикронной волны на рубеже 2021/2022 годов лаборатории были полностью перегружены первичным тестированием. , и этот метод помог нам отслеживать развитие омикронного варианта у населения Швеции в режиме реального времени», — говорит Бьорн Рейниус, руководитель исследовательской группы того же отдела и последний автор исследования.

По словам исследователей, новый метод точен и надежен. Проверки качества были выполнены по сравнению с секвенированием вирусного генома, показывая, что метод имел более чем 99% согласованности в классификации вариантов.

Отслеживание быстрого перехода от омикрон BA.1 к BA.2

Всего через несколько недель после начала омикронной волны в Швецию прибыла еще более заразная форма вируса — омикрон BA.2. Метод, разработанный исследователями, оказался полезным и в этом случае. Если в анализе был обнаружен SARS-CoV-2, но не BA.1, тест был положительным на BA.2, потому что другие варианты COVID уже были вытеснены.

В период с января по март 2022 года исследовательская группа проанализировала 174 933 клинических образца верхних дыхательных путей в тесном сотрудничестве с ABC Labs, которая в то время помогала Агентству общественного здравоохранения Швеции и шведским регионам здравоохранения с аналитическими возможностями.

«Мы увидели, что уровни вируса, определяемые количественно как копии вирусного генома , в верхних дыхательных путях людей, инфицированных омикроном BA.2, были почти в два раза выше по сравнению со случаями BA.1. Наши данные могут помочь объяснить, почему омикрон BA.2 распространяется так агрессивно и быстро вытеснили BA.1 из популяции», — говорит Бьорн Рейниус.

В настоящее время исследователи работают над разработкой новых методов диагностики вирусных и бактериальных инфекций. Их цель — разработать единый клинический тест, который может одновременно выявлять большое количество инфекционных заболеваний.

Добавить комментарий