Новая система скрининга новорожденных использует быстрое секвенирование всего генома для скрининга и диагностики генетических заболеваний

Детский институт геномной медицины Рэди (RCIGM) сегодня объявил о публикации исследования в Американском журнале генетики человека (AJHG), описывающего масштабируемый прототип скрининга новорожденных (NBS), который включает диагностику генетических заболеваний с помощью быстрого полногеномного секвенирования (rWGS). ) и виртуальное руководство по неотложной помощи.

«Эта система NBS-rWGS предназначена для дополнения существующего процесса скрининга новорожденных и может устранить диагностическую и терапевтическую одиссею, с которой сталкиваются многие дети и родители», — сказал Стивен Кингсмор, доктор медицинских наук, президент и генеральный директор RCIGM и ведущий автор. . «В настоящее время для скрининга новорожденных в Соединенных Штатах рекомендуется только 35 основных генетических заболеваний, но известно более 7200 генетических заболеваний . Результаты для новорожденных с генетическими заболеваниями остаются плохими из-за ограниченного числа рекомендуемых скринингов. С NBS-rWGS , мы можем быстрее увеличить это число и, следовательно, потенциально улучшить результаты с помощью точной медицины».

В исследовании авторы использовали установленные критерии, метод Дельфи, электронный сбор данных и консенсус группы детских генетиков по шести вопросам, чтобы определить включение вмешательств и нарушений в «Геном к лечению» (GTRx), автоматизированный, виртуальный система управления заболеваниями, которая объединяет диагностику rWGS с пользовательской системой управления лабораторной информацией и конвейером анализа. Они рассмотрели 457 генетических заболеваний и выбрали 388 для включения в NBS-rWGS. После моделирования NBS-rWGS у 454 707 субъектов британского биобанка с 29 865 патогенными или вероятно патогенными вариантами, связанными с этими 388 генетическими заболеваниями, они определили, что NBS-rWGS имеет специфичность 99,7%.

У 2208 детей в критическом состоянии с подозрением на генетические нарушения и у 2168 их родителей исследователи обнаружили, что смоделированная NBS-rWGS выявила 104 из 119 диагнозов, ранее поставленных с помощью rWGS, и выявила 15 результатов, о которых ранее не сообщалось. Отрицательная прогностическая ценность и чувствительность NBS-rWGS (99,6% и 88,8% соответственно) были несколько выше, чем у диагностической rWGS. Более ранние вмешательства могли заметно улучшить результаты и сократить количество госпитализаций у 43 из 104 детей в критическом состоянии.

Смоделированный NBS-rWGS выявил генетические заболевания у 15 новорожденных, которые не были пропущены при обычном скрининге новорожденных. Кроме того, у 60 из 104 детей с генетическими заболеваниями, выявленными с помощью имитации NBS-rWGS, исследователи подсчитали, что выполнение NBS-rWGS в течение пяти дней после рождения могло сократить время постановки диагноза в среднем на 73 дня. Они определили, что это могло потенциально полностью избежать симптомов у семи из этих новорожденных.

«Результаты этого исследования демонстрируют потенциал скрининга новорожденных с помощью быстрого секвенирования всего генома, чтобы помочь сократить время диагностики сотен генетических заболеваний», — сказал Том Дефай, соавтор и заместитель руководителя Alexion по стратегии и развитию диагностики. «В рамках нашего стремления помочь пациентам и их семьям быстрее получать ответы, мы продолжаем сотрудничать с Детским институтом геномной медицины Рэди, поскольку они работают над усовершенствованием и масштабированием этой инновационной технологии».

14 июня 2022 г. RCIGM официально запустила NBS-rWGS под своим новым названием BeginNGS. RCIGM начнет клиническое исследование эффективности BeginNGS для диагностики и предоставления рекомендаций по лечению ~ 400 тяжелых генетических состояний раннего детства до появления симптомов. Исследование определит полезность GTRx для поддержки врачей, когда они принимают решения о лечении редких заболеваний, которые они могут лечить только несколько раз в течение своей карьеры. На последующих этапах начнется набор в исследование, за которым последует расширение тестирования до ~ 500 расстройств. Конечная цель BeginNGS — стать стандартом скрининга генетических заболеваний, ежегодно проводя тестирование на наличие около 1000 заболеваний и секвенирование 3,7 миллиона новорожденных в Соединенных Штатах.

Добавить комментарий