Новое исследование, проведенное Оксфордским университетом, показало, что высокая доля инфекций SARS-CoV-2 среди населения в целом приводит к персистирующим инфекциям, продолжающимся месяц и более. Результаты были опубликованы в журнале Nature .
Долгое время считалось, что длительная инфекция COVID-19 у людей с ослабленным иммунитетом могла быть источником множества новых вариантов, возникших во время пандемии коронавируса и посевавших последовательные волны инфекции, включая варианты альфа и омикрон. Но до сих пор оставались неизвестными распространенность стойких инфекций COVID-19 среди населения в целом и то, как вирус развивается в этих ситуациях.
Чтобы выяснить это, исследователи использовали данные Управления национальной статистики по исследованию инфекции COVID (ONS-CIS), которое тестировало участников примерно ежемесячно.
Из более чем 90 000 участников 3603 предоставили два или более положительных образца в период с ноября 2020 года по август 2022 года, где вирус был секвенирован. Из них 381 человек дал положительный результат на ту же вирусную инфекцию в течение месяца или дольше.
В этой группе у 54 человек была стойкая инфекция, продолжавшаяся не менее двух месяцев. По оценкам исследователей, от одного из тысячи до одного из 200 (0,1–0,5%) всех инфекций могут стать стойкими и длиться не менее 60 дней.
В некоторых случаях люди оставались инфицированными вариантами вируса, которые вымерли в общей популяции. Напротив, исследователи обнаружили, что повторное заражение тем же вариантом встречается очень редко, вероятно, из-за того, что у хозяина развивается иммунитет к этому варианту, а частота этого варианта снижается до очень низкого уровня через несколько месяцев.
Из 381 персистирующей инфекции 65 прошли три или более ПЦР-теста в ходе заражения. Большинство (82%) этих людей продемонстрировали восстановление динамики вируса, демонстрируя сначала высокую, затем низкую, а затем высокую динамику вирусной нагрузки. По мнению исследователей, это демонстрирует, что вирус может сохранять способность активно размножаться при длительных инфекциях.
В исследовании люди с персистирующими инфекциями на 55% чаще сообщали о наличии у них длительных симптомов Covid более 12 недель с момента начала инфекции, чем люди с более типичными инфекциями.
У некоторых людей наблюдалось чрезвычайно большое количество мутаций, включая мутации, которые определяют новые варианты коронавируса, изменяют сайты-мишени для моноклональных антител и вносят изменения в шиповый белок коронавируса. Однако у большинства людей не было большого количества мутаций, что позволяет предположить, что не каждая персистирующая инфекция будет потенциальным источником новых вызывающих беспокойство вариантов.
Соруководящий автор исследования д-р Махан Гафари (Институт пандемических наук, медицинский факультет Наффилда, Оксфордский университет) сказал: «Наши наблюдения подчеркивают сохраняющуюся важность геномного надзора на уровне сообщества как для мониторинга появления, так и распространения новых вариантов». но также получить фундаментальное понимание естественной истории и эволюции новых патогенов и их клинического значения для пациентов».
Соведущий автор д-р Катрина Литгоу (Факультет биологических и пандемических наук Института Оксфордского университета) сказала: «Хотя связь между персистенцией вируса и длительным течением COVID не может быть причинно-следственной, эти результаты позволяют предположить, что персистирующие инфекции могут способствовать патофизиологии Действительно, было предложено множество других возможных механизмов, способствующих затянувшемуся COVID, включая воспаление, повреждение органов и микротромбоз».