Способствуют ли пациенты с длительными инфекциями появлению новых вариантов SARS-CoV-2? Исследовательская группа из Института вирусологии им. Лейбница (LIV) и Университетского медицинского центра Гамбург-Эппендорф (UKE) более подробно изучила этот вопрос и теперь смогла показать, что не длительная инфекция сама по себе приводит к появление новых вариантов. Скорее, для этого требуется эволюционное узкое место, которое может быть создано противовирусным лечением. Результаты теперь опубликованы в журнале Cell Reports Medicine в качестве предварительной версии.
Продолжительные инфекции SARS-CoV-2 возникают в основном у пациентов с ослабленным иммунитетом и неоднократно обсуждались как важные участники эволюции вируса . лечение, такое как ремдесивир или реконвалесцентная плазма, оказывает давление отбора для приобретения ускользающих мутаций.
Анализ геномного разнообразия при затяжных инфекциях
В опубликованном исследовании исследовательская группа под руководством профессора Адама Грундхоффа (LIV) и профессора Николь Фишер (UKE) в настоящее время изучает, обычно ли у пациентов с длительными инфекциями наблюдается повышенная вирусная эволюция, которая может способствовать более быстрому возникновению атипичной пневмонии. Варианты CoV-2 или способствуют ли определенные схемы лечения возникновению новых мутаций.
С этой целью геномное разнообразие в организме хозяина было исследовано путем секвенирования всего генома в продольных образцах от 14 пациентов с длительной вирусной персистенцией (30–146 дней) во время тяжелого заболевания COVID-19; включая пациентов с ослабленным иммунитетом и иммунокомпетентных пациентов с противовирусным лечением или без него, для оценки возникновения мутаций с давлением отбора и без него.
«В целом вирус был удивительно стабилен у подавляющего большинства исследованных лиц. Однако у одного пациента, получавшего ремдесивир, мы наблюдали большое количество мутаций сразу после начала лечения, включая по крайней мере одну мутацию, которая была весьма вероятной. чтобы придать повышенную устойчивость к ремдесивиру», — объясняет профессор Адам Грундхофф, глава исследовательской группы LIV Virus Genomics.
Противовирусное лечение способствует эволюционному узкому месту
У пациентов с длительной инфекцией SARS-CoV-2 и противовирусным лечением Ремдесивиром наблюдалось значительное увеличение разнообразия вируса внутри хозяина с новыми возникающими мутациями. Напротив, у пациентов, получавших только противовоспалительное лечение, появление новых вариантов наблюдалось лишь спорадически.
«Наша работа показывает, что не долгая продолжительность инфекции сама по себе приводит к появлению новых вариантов. Скорее, для этого требуется эволюционное узкое место, такое как может быть создано противовирусным лечением. Это открытие особенно важно с учетом недавние дискуссии об использовании ремдесивира для лечения не госпитализированных пациентов с высоким риском, а также для внедрения потенциально новых противовирусных препаратов», — говорит профессор Николь Фишер из UKE.
