Группа исследователей из Стэнфордского университета, работающая с двумя коллегами из Фуданьского университета и еще одним из Института Брода Массачусетского технологического института и Гарварда, обнаружила доказательства того, что генетические варианты, которые препятствуют редактированию РНК A-to-I, могут быть связаны с повышенным риском аутоиммунные нарушения. В своей статье, опубликованной в журнале Nature , группа описывает, как они проанализировали данные о генетической экспрессии из образцов тканей, собранных у сотен доноров-людей, для выявления генетических вариантов, влияющих на редактирование РНК, и что они узнали при этом. Каур Аласоо из Тартуского университета в Эстонии опубликовал статью «Новости и мнения» в том же номере журнала, в которой рассказывается о работе, проделанной командой над этим новым проектом.
Предыдущие исследования показали, что генетические варианты могут увеличить риск развития у человека определенных заболеваний. В некоторых случаях они делают это, воздействуя на РНК — такие варианты могут приводить к образованию большего или меньшего количества, чем обычно, или к различиям в транскрибируемых последовательностях. В последнем случае такие различия могут привести к проблемам с секвенированием аминокислот.
Также было обнаружено, что варианты оказывают влияние на молекулы РНК, поскольку они подвергаются редактированию РНК от A к I, что представляет собой процесс, в котором субъединицы РНК претерпевают изменения с аденозина на инозин. В этой новой попытке исследователи изучили возможность связи между этими видами вариантов и аутоиммунными расстройствами.
Работа команды включала извлечение данных из каталога экспрессии генотипа и ткани и их фильтрацию, чтобы найти примеры вариантов, влияющих на редактирование РНК. При этом они обнаружили данные тканей 838 доноров-людей с такими вариантами. При анализе вариантов они обнаружили, что они влияют на силу связывания между аденозиндезаминазой и РНК.
Затем исследователи обнаружили, что варианты были распространены у людей с аутоиммунными заболеваниями , такими как волчанка. И, наконец, они обнаружили, что одни и те же варианты, по-видимому, имеют более сильную связь с такими заболеваниями, чем с вариантами, участвующими в сплайсинге генов. В заключение они предположили, что наблюдаемые ими типы генных вариантов, которые приводят к ослаблению редактирования РНК от A до I, по-видимому, связаны с повышенным риском аутоиммунных заболеваний.